Diagnósticos point-of-care: amplificación isotérmica mediada por asas como alternativa para la detección y prevención del síndrome urémico hemolítico
DOI:
https://doi.org/10.62035/rca.1.12Palabras clave:
Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos, LAMP, E. coli O157:H7, gen rfbE, Técnicas point-of-careResumen
El Síndrome Urémico Hemolítico (SUH) es una enfermedad que se caracteriza por un fracaso renal agudo (o crónico) que afecta
principalmente a la población pediátrica. Su etiología es variable, aunque la más frecuente está asociada a la ingesta de alimentos contaminados con Escherichia coli productora de toxina Shiga. En Argentina, esta enfermedad representa un grave problema de salud pública debido a la tasa alta de ocurrencia y a la falta de un tratamiento específico; esto revela la importancia de la inmediatez y la eficiencia con que intervienen todos los agentes involucrados en la prevención primaria a fin de reducir el impacto sanitario. En este entramado se discute la aplicación de la técnica de Amplificación Isotérmica de ácidos nucleicos Mediada por Asas (LAMP, por sus siglas en inglés), cómo método de diagnóstico alternativo a la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés), hoy ampliamente utilizada en centros de referencia. Para el desarrollo de este trabajo se llevó a cabo una revisión bibliográfica para analizar el contraste PCR vs LAMP en el marco de los requisitos “ASSURED” de técnicas point-of-care adoptados por la Organización Mundial de la Salud. Con un inicial abordaje molecular, se resaltan características diagnósticas, tales como la universalidad de la aplicación, especificidad, sensibilidad de la técnica, las cuales postulan a la LAMP como una herramienta rápida, oportuna y confiable para la detección de una gran cantidad de patógenos bacterianos.
Citas
- Rivas, M., Miliwebsky, E., Chinen, I., Deza, N. A. T. A. L. I. A., & Leotta, G. A.. Epidemiologia del síndrome urémico hemolítico en argentina. Diagnóstico del agente etiológico, reservorios y vías de transmisión. 2006.
- Mercado, Elsa C. Síndrome Urémico Hemolítico: ¿por qué Argentina? Revista Argentina de Microbiología, vol. 39, núm. 4, diciembre, 2007, pp. 191-192. Asociación Argentina de Microbiología. Buenos Aires, Argentina.
- Rivas, M., Miliwebsky, E., Chinen, I., Roldán, C. D., Balvi, L., Garcia, B. & Griffin, P. M.. Characterization and epidemiologic subtyping of Shiga toxin–producing Escherichia coli strains isolated from hemolytic uremic syndrome and diarrhea cases in Argentina. Foodbourne Pathogens & Disease. 2006; 3(1), 88-96.
- Yu, G., Niu, J., Shen, M., Shao, H., & Chen, L. Detection of Escherichia coli O157 using equal-length double-stranded fluorescence probe in a real-time polymerase chain reaction assay. Clinica chimica acta. 2006; 366(1-2), 281-286.
- De Vigilancia, E. D. B. I. (2014). SÍNDROME URÉMICO HEMOLÍTICO (SUH) EN ARGENTINA, 2010-2013. Extracto del Boletín Integrado de Vigilancia N° 222 - SE 30 Agosto 2014.
- SÍNDROME URÉMICO HEMOLÍTICO (SUH) EN ARGENTINA, 2010-2013 Extracto del Boletín Integrado de Vigilancia N° 222- SE 30 Agosto 2014.
- Parida, M., Horioke, K., Ishida, H., Dash, P. K., Saxena, P., Jana, A. M., & Morita, K. Rapid detection and differentiation of dengue virus serotypes by a real-time reverse transcription loop-mediated isothermal amplification assay. Journal of clinical microbiology. 2005; 43(6), 2895-2903.
- REVISADA, Segunda Edición. Módulo de Principios de Epidemiología para el Control de Enfermedades (MOPECE) 2011.
- Hernández-Aguado, I., Lumbreras, B., & Jarrín, I. La epidemiología en la salud pública del futuro. Revista española de salud pública. 2006; 80(5), 469-474.
- Boletín Integrado de Vigilancia, Dirección Nacional de Epidemiología y Análisis de la Situación de la Salud N° 410 – SE 22 2018, Mayo de 2018. Presidencia de la Nación.
- Roldán, M. L., Chinen, I., Otero, J. L., Miliwebsky, E. S., Alfaro, N., Burns, P., & Rivas, M. Aislamiento, caracterización y subtipificación de cepas de Escherichia coli O157: H7 a partir de productos cárnicos y leche. Revista argentina de microbiología. 2007; 39(2), 113-119.
- Spizzirri, F. D., Rahman, R. C., Bibiloni, N., Ruscasso, J. D., & Amoreo, O. R. Childhood hemolytic uremic syndrome in Argentina: long-term follow-up and prognostic features. Pediatric Nephrology. 1997; 11(2), 156-160.
- Kosack, C. S., Page, A. L., & Klatser, P. R. A guide to aid the selection of diagnostic tests. Bulletin of the World Health Organization. 2017; 95(9), 639.
- Cavero, T., & Alonso, M. Síndrome hemolítico urémico: estado actual. Medicina Clínica. 2018; 151(8), 329-335.
- LaBarre, P., Boyle, D., Hawkins, K., & Weigl, B. Instrument free nucleic acid amplification assays for global health settings. In Sensing Technologies for Global Health, Military Medicine, Disaster Response, and Environmental Monitoring; and Biometric Technology for Human Identification VIII (Vol. 8029, p. 802902). International Society for Optics and Photonics. 2011.
- Administración Nacional de Medicamentos, Alimentos y Tecnología médica. [Internet]. Sección Alimentos, Ficha técnica número 8 Enfermedades transmitidas por alimentos. Disponible en http://www.anmat.gov.ar/alimentos/ficha_enfermedades_alimentos_SUH.pdf.
- USDA/FSIS. Detection, Isolation and Identification of Escherichia coli O157:H7/NM from Meat Products. Revisión MLG 5.05, 10/01/2010.
- Jure, M. A., Condorí, S., Leotta, G. A., Chinen, I., Miliwebsky, E., Allori, C. & De Castillo, M. C. Detección, aislamiento y caracterización de Escherichia coli productor de toxina Shiga a partir de carne molida fresca proveniente de carnicerías de Concepción, provincia de Tucumán. 2010.
- Wong, Y. P., Othman, S., Lau, Y. L., Radu, S., & Chee, H. Y. Loop‐mediated isothermal amplification (LAMP): a versatile technique for detection of micro‐organisms. Journal of Applied Microbiology. 2018; 124(3), 626-643.
- Zhao, X., Li, Y., Wang, L., You, L., Xu, Z., Li, L., ... & Yang, L. Development and application of a loop-mediated isothermal amplification method on rapid detection Escherichia coli O157 strains from food samples. Molecular biology reports. 2010; 37(5), 2183-2188.
- Ranjbar, R., Erfanmanesh, M., Afshar, D., Mohammadi, M., Ghaderi, O., & Haghnazari, A. Visual Detection of Enterohemorrhagic Escherichia coli O157: H7 Using LoopMediated Isothermal Amplification. Electronic physician. 2016; 8(6), 2576.
- Hara-Kudo, Y., Nemoto, J., Ohtsuka, K., Segawa, Y., Takatori, K., Kojima, T., & Ikedo, M. Sensitive and rapid detection of Vero toxin-producing Escherichia coli using loop-mediated isothermal amplification. Journal of Medical Microbiology. 2007; 56(3), 398-406.
- Ferrer, E. Técnicas moleculares para el diagnóstico de la enfermedad de Chagas. SABER. Revista Multidisciplinaria del Consejo de Investigación de la Universidad de Oriente. 2015; 27(3), 359-371.
- Ravan, H., Amandadi, M., & Sanadgol, N. A highly specific and sensitive loop-mediated isothermal amplification method for the deo5tection of Escherichia coli O157: H7. Microbial pathogenesis. 2016; 91, 161-165.
- Bertrand, R., & Roig, B. Evaluation of enrichment-free PCR based detection on the rfbE gene of Escherichia coli O157— application to municipal wastewater. Water research. 2007; 41(6), 1280-1286.
- Lee, N., Baker, J., Andrews, K.T., et al., “Effect of sequence variation in Plasmodium falciparum histidine-rich protein 2 on binding of specific monoclonal antibodies: Implications for rapid diagnostic tests for malaria,” Journal of Clinical Microbiology. 2006; 44(8), 2773–2778.
- Lee, N., Baker, J., Bell, D., et al., “Assessing the genetic diversity of the aldolase genes of Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax and its potential effect on performance of aldolase-detecting rapid diagnostic tests,” Journal of Clinical Microbiology. 2006; 44(12), 4547–4549.
- Murray, C.K., Gasser Jr., R.A., Magill, A.J., et al., “Update on rapid diagnostic testing for malaria,” Clinical Microbiology Reviews. 2008; 21(1), 97–110.
- Arroyo, M. I., Morales, G. P., Sosa, P. A., Carmona-Fonseca, J., & Maestre, A. Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica:[revisión]. Med. UIS. 2008; 21(3), 158-175.
- Dantas, V. V., Cardoso, G. V. F., Araújo, W. S. C., de Oliveira, A. C. D. S., da Silva, A. S., da Silva, J. B., ... & Lourenço, L. D. F. H. Aplicación de un ensayo de Reacción en Cadena de la Polimerasa multiplex (mPCR) para detectar fraude por substitución de cortes de carne bovina por carne de búfalo en el norte del Brasil. CyTA: Journal of food. 2019; 17(1), 790-795.
- Ocwieja, K. E., Sherrill-Mix, S., Liu, C., Song, J., Bau, H., & Bushman, F. D. A reverse transcription loop-mediated isothermal amplification assay optimized to detect multiple HIV subtypes. PloS one. 2015; 10(2), e0117852.
- Marzocca, M. A., Marucci, P. L., Sica, M. G., & Álvarez, E. E. Detección de Escherichia coli O157: H7 en carne picada fresca y hamburguesas congeladas. Revista argentina de microbiología, 2006; 38(1), 38-40.
- Chiluisa-Utreras, V. P., Cabrera-Rodríguez, M. A., & Valladares-Torres, P. K. Detección de Listeria spp. y Listeria monocytogenes en muestras de leche cruda y quesos artesanales respectivamente, mediante PCR en Tiempo Real. Respuestas. 2017; 22(2), 67-75.
- Malucelli, G et al. Extracción de biomacromoléculas de tejidos vegetales para su aplicación en el campo de los retardadores del fuego (Doctoral dissertation, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO). 2016.
- Horisaka, T., Fujita, K., Iwata, T., Nakadai, A., Okatani, A. T., Horikita, T., & Hayashidani, H. Sensitive and specific detection of Yersinia pseudotuberculosis by loop-mediated isothermal amplification. Journal of Clinical Microbiology, 2004; 42(11), 5349-5352.
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución 4.0.
Los artículos se publican bajo una Licencia Creative Commons de Reconocimiento 4.0 Internacional (CC BY 4.0).
Esta licencia permite compartir y adaptar el material. Se puede distribuir el material en cualquier medio o formato y remezclar, transformar y crear a partir del mismo para cualquier finalidad, incluso comercial. Bajo la condición de reconocer adecuadamente la autoría, proporcionar un enlace a la licencia e indicar si se han realizado cambios.
